Le Cnam organise la formation à et par la recherche des doctorants à travers une école doctorale de site (ED Abbé-Grégoire) et une école doctorale en co-accréditation (SMI). Le Cnam offre une trentaine de spécialités en doctorat aussi bien en sciences humaines et sociales et sciences de gestion, qu’en sciences pour l’ingénieur.
La Direction de la recherche coordonne et mutualise les actions à mener dans le cadre des écoles doctorales.